Міжсоборну присутність засновано Синодом РПЦ на засіданні 27 липня 2009 року, який відбувся у Києві.
За повідомленням офіційного сайту УПЦ, були утворені наступні комісії:
- З питань богослов'я;
- З питань церковного управління та механізмів здійснення соборності в Церкві;
- З питань церковного права;
- З питань богослужіння і церковного мистецтва;
- З питань парафіяльного життя та парафіяльної практики;
- З питань організації церковної місії;
- З питань організації життя монастирів і чернецтва;
- З питань духовної освіти і релігійної освіти;
- З питань організації церковно-соціальної діяльності та благодійництва;
- Комісії з питань взаємодії Церкви, держави і суспільства;
- З питань протидії церковним розколам і їх подолання;
- З питань ставлення до інослав'я та інших релігій;
- З питань інформаційної діяльності Церкви та стосунків зі ЗМІ;
Кілька комісій очолили Предстоятель і архиєреї Української Православної Церкви, а саме:
Митрополит Володимир став головою комісії з питань протидії церковним розколам і їх подолання;
Керуючий справами УПЦ архиєпископ Білоцерківський і Богуславський Митрофан (Юрчук) – комісію з питань парафіяльного життя та парафіяльної практики, а ректор Київських духовних академії та семінарії архиєпископ Бориспільський Антоній очолив комісію з питань духовної освіти і релігійної освіти.
Міжсоборну присутність засновано Синодом РПЦ на засіданні 27 липня 2009 року, який відбувся у Києві.
Предстоятель Російської Православної Церкви підкреслив, що перше засідання президії Міжсоборної присутності є історичною подією: у жодній Помісній Православній Церкві немає подібного дискусійного майданчика, до складу якої входять єрархи, священнослужителі, ченці й миряни. «Це унікальний консультативний орган Російської Православної Церкви, покликаний випрацьовувати рішення на найвищому рівні церковного управління – Архиєрейському і Помісному Соборах», – зазначив Патріарх Кирил.