Автор одинадцяти книг, Аллен був відомий як енергійний і допитливий репортер, який «розмовляв з усіма», а також як справедливий і зважений аналітик церковних справ. Його колонки відображали інтелектуальну цікавість не тільки до тонкощів ватиканської політики, але й до таємниць італійської католицької народної культури та арканів церковної історії, які він досліджував з гумором і витонченістю. Його твори були жвавими, гумористичними та проникливими. Аллен не обмежувався церковною пресою, з'являючись у New York Times та на National Public Radio. Він уникав потрапляння в табір «ліберальних католиків» або «консервативних католиків». Він також виявляв інтелектуальну скромність: коли його біографія тодішнього кардинала Ратцингера була розкритикована за упередженість, він визнав свою помилку і написав іншу, більш зважену біографію людини, яка на той час була Папою Бенедиктом XVI. Про широту і глибину його переконань та зв'язків свідчить те, що, дізнавшись про його смерть, відомий консервативний мислитель Род Дреєр, автор книги «Бенедикт Опція» і католик, який перейшов у православ'я, опублікував на X особливо теплу і вдумливу оцінку. Джона Аллена також пам'ятають як товариського поціновувача життя, який глибоко цінував задоволення від трапези.

Він також був другом Української Греко-Католицької Церкви.

Це сталося не випадково. Україна та її Церкви часто ігнорувалися – або, що гірше, зневажалися – пресою, а репутація України в Римі була неоднозначною. Ситуація покращилася наприкінці 1980-х років, коли в римському офісі Верховного Архиєпископа кардинала Мирослава Івана Любачівського було створено прес-службу, саме тоді, коли його Церква виходила з катакомб. Але хоча незалежність України в 1991 році супроводжувалася відновленням і легалізацією УГКЦ, посилення антиукраїнської риторики російської пропаганди в епоху Путіна після 2000 року створило нову загрозу.

У цей час Аллен, уродженець Канзасу, був ватиканським кореспондентом американського видання National Catholic Reporter. У березні 2012 року президент Українського патріархального товариства в США Рома Гайда запросила Аллена відвідати Львів як гостя Товариства. Аллен провів три дні у Львові в жовтні того ж року, беручи інтерв'ю у ректора Українського католицького університету єпископа Бориса Гудзяка та виступаючи на конференції, організованій Українським патріархальним товариством 20 жовтня.

Два роки по тому, у 2014 році, Джон Аллен залишив National Catholic Reporter і, у партнерстві з Boston Globe, заснував інформаційне агентство Crux. Він також працював старшим аналітиком Ватикану для CNN. Crux стало головним джерелом католицьких новин: після свого сходження на папський престол 8 травня 2025 року Папа Лев XIV надав його кореспондентці Елізі Енн Аллен, дружині Джона Аллена, своє перше ексклюзивне інтерв'ю. Протягом цих років Джон Аллен неодноразово писав і говорив про Україну. Серед його матеріалів для Crux і Crux Now були «Чи поїде Папа до України?», «Кардинал вижив після нападу в Україні», «Секретна зброя Папи для миру» та «Папа відкидає заборону православ'я в Україні».

Хоча Україна більше не зможе користуватися репортажами Джона Аллена, українські журналісти можуть взяти з нього цінний урок. Напередодні запланованої лекції в Українському католицькому університеті в 2012 році Аллен підготував меморандум на тему «Репортажі про чутливі та суперечливі теми: баланс між вірністю та об’єктивністю». Насамперед він зазначив, що не вважає себе «католицьким журналістом», а «скоріше журналістом, який випадково є католиком». На його думку, роль репортерів не полягає в євангелізації. Натомість він відчував покликання до «справедливості, збалансованості, точності та висвітлення всієї історії». Водночас він вказав на проблему непорозуміння між світськими ЗМІ та Католицькою Церквою. З одного боку, світські ЗМІ не сприймали релігію серйозно, задовольняли упередження окремих груп читачів, задовольнялися своєчасними, але поверхневими репортажами і, як правило, ставилися до інституцій з глибоким скептицизмом. З іншого боку, Церква, яка «мислить століттями», повільно реагувала на події, не включила комунікації у свій процес прийняття рішень, занадто швидко сприймала «релігійну неграмотність» журналістів як ворожість і стала настільки політизованою та розділеною, що затуманила свою справжню позицію з певних питань. Прикладом такого взаємного нерозуміння між Церквою та світськими ЗМІ було висвітлення останніми сексуального насильства з боку духовенства, яке було зіпсоване відсутністю порівняльного контексту.

Яким було рішення Аллена щодо виправлення цих недоліків у відносинах? По-перше, журналісти зобов'язані «правильно висвітлювати події». Для Церкви «певна відстороненість від турботи про свій «імідж» є духовно здоровою». Проте вона не може успішно проводити «нову євангелізацію», якщо не вживе заходів «для поліпшення свого публічного іміджу, не зраджуючи себе». На закінчення Аллен зазначає, що «однією з ключових якостей, необхідних Церкві у її відносинах із ЗМІ, є почуття гумору, тобто здатність сміятися над собою та своїми слабкостями».

Українські журналісти – і українські Церкви – зробили б добре, якби взяли до уваги пораду Джона Аллена.